他出生于石勒苏益格公国（现位于丹麦日德兰南部的亚本拉市）的布尔克洛克，他的父亲是画家兼木匠亨里克·维尔赫尔姆·埃克斯伯格和英格堡·尼尔斯达特。他继续为被称为丹麦绘画黄金时代的艺术奠定基础，并被称为丹麦绘画之父。
1786年，埃克斯伯格的家人搬到了风景如画的阿尔松附近的一个村庄布莱斯，在那里他喜欢画周围乡村的图画，并乘坐父亲的船进行航海旅行。在确认之后，他开始了他的训练，成为教会的画家和亚本拉的肖像画家杰斯·杰森（1797-1800）。
他进步很快，画历史画、肖像画和风景画。然而，他和阿比德加德之间的摩擦阻碍了他的进步，直到1809年阿比德加德去世后，他才获得学院的大金牌。他还做手工活挣生活费，还画铜版蚀刻画。
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